什么是PCR(聚合酶链式反应)?PCR 是一种在实验室中使用的技术,用于复制特定 DNA 片段的数百万个副本。聚合酶链式反应 (PCR) 最初由美国生物化学家 Kary Mullis 于 1983 年开发。因其开创性工作,他于1993年荣获诺贝尔化学奖。在Covid-19 大流行期间,通过PCR技术检测一个人是否感染该病毒。
PCR是如何工作呢?
PCR反应体系及作用
1、要复制的 DNA 模板。
2、引物——DNA 或 RNA 的短片段,长度为 20 到 30 个碱基,结合感兴趣的 DNA 片段的任一侧并标记 PCR 的起始点。
3、DNA 核苷酸碱基(也称为 dNTP)。 DNA 碱基(A、T、C 和 G)是 DNA 的组成部分,是构建新 DNA 链所必需的。
4、一种称为 Taq 聚合酶的酶,它将碱基添加到复制的序列中。
5、缓冲液以确保反应有合适的条件。
PCR步骤
PCR 具有三个主要阶段,其中涉及加热和冷却过程:
步骤1,变性:将双链模板DNA加热,使其分离成两条单链。
步骤2,退火:降低温度,使DNA引物附着到模板DNA上。
第三步,延伸:再次升高温度,Taq聚合酶产生新的DNA链。
这三个阶段重复 20-40 次,每次 DNA 拷贝数加倍。这称为热循环,由机器执行。
它是由一台称为热循环仪的机器执行的。根据机器的速度,PCR 可以在不到一小时或长达几个小时内完成。
PCR 完成后,可以使用一种称为电泳的方法来检查产生的 DNA 片段的数量和大小。
聚合酶链式反应 (PCR) 中主要步骤的插图
PCR 的每个步骤详解
第一步:变性
将反应混合物加热至 94-95°C,持续 15 至 30 秒。
高温导致模板 DNA 两条链中碱基之间的氢键断裂,两条链分离。
这会产生两条单链 DNA,它将作为模板产生每条 DNA 链的新副本。
重要的是,在此阶段保持温度足够长的时间,以确保 DNA 链完全分离。
第 2 步:退火
将反应冷却,使引物能够通过氢键连接到单链模板 DNA 上的特定位置。
温度取决于底漆的特性,但通常在 50 至 65⁰C 之间。
两条分离的 DNA 链是互补的,并且以相反的方向延伸(从一端 – 5' 端 – 到另一端 – 3' 端)。因此,有两种引物——正向引物和反向引物。
此步骤至关重要,因为引物通过提供供聚合酶使用的短双链 DNA 区域而充当 DNA 合成的起点。只有引物结合后,聚合酶才能附着并开始在延伸步骤中从松散的 DNA 碱基生成新的互补 DNA 链。
退火步骤通常需要大约10-30秒。
第三步:扩展
热量升至 72⁰C,以便通过添加 DNA 碱基的特殊 Taq DNA 聚合酶生成新 DNA。
Taq DNA 聚合酶是一种取自水生栖热菌 (“Taq”) 的酶:
这种细菌通常生活在温泉中,可以耐受80℃以上的温度,但最适温度为72℃。
该细菌的 DNA 聚合酶在高温下非常稳定,这意味着它可以承受在 PCR 变性阶段将 DNA 链分开所需的温度。
大多数其他生物体的 DNA 聚合酶无法承受如此高温。例如,人类聚合酶在 37°C(体温)下工作效果最佳。
在 72⁰C 时,Taq 聚合酶开始构建互补链。它附着在引物上,然后沿 5' 到 3' 方向将 DNA 碱基一一添加到单链上。
结果是一条全新的 DNA 链和双链 DNA 分子。
此步骤的持续时间取决于被扩增的 DNA 序列的长度。复制 1,000 个 DNA 碱基通常需要大约一分钟。
第四步:重复该过程
这三个热循环过程重复 20-40 次,以产生大量感兴趣的 DNA 序列的副本。
PCR 过程中产生的新 DNA 片段也可以作为 DNA 聚合酶可以附着并开始产生 DNA 的模板。
结果是在相对较短的时间内产生大量特定 DNA 片段的拷贝。
插图显示聚合酶链式反应 (PCR) 如何产生大量 DNA 副本
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